出水VFA濃度在反應器控制中被認為是最重要的參數(shù)。這是因為VFA的除去程度可以直接反映出反應器運行狀況，通過VFA濃度的分析，可以較為快速和靈敏的判斷出反應器行為的微小變換。正常情況下，底物由酸化菌轉(zhuǎn)化為VFA，VFA可以被甲烷菌轉(zhuǎn)化為甲烷。因此甲烷菌活躍時，出水VFA濃度較低。當出水VFA濃度低于3mmol/L（或200mg乙酸/L）時，反應器的運行狀態(tài)最為良好。

任何不利于甲烷菌生長的因素都會導致出水VFA濃度的上升，這是因為甲烷菌活性降低使VFA積累所致。溫度的突然降低或升高、毒性物質(zhì)濃度的增加、pH值的波動、負荷的突然加大等都會由出水VFA的濃度反映出來。進水狀態(tài)穩(wěn)定時出水pH的下降也能反映出VFA的升高，但是pH的變化比VFA的變化遲緩，因此從監(jiān)測出水的VFA濃度可快速反映出反應器運行的狀況。

過負荷常是出水VFA升高的原因。因此當出水VFA升高而環(huán)境因素（溫度、進水pH、出水水質(zhì)等）沒有明顯變化時，出水VFA的升高可由降低反應器負荷來調(diào)節(jié)。

出水VFA濃度的升高直接影響廢水的處理效果，過高的出水VFA濃度表明反應器內(nèi)大量的VFA積累，因此是反應器pH下降或?qū)е隆八峄钡那捌谟嵦枴Ｒ话阏J為，當VFA濃度超過800mgCOD/L時，反應器即面臨酸化危險，正常運行中，應保持出水VFA濃度在400mgCOD/L以下，而以200mgCOD/L以下為最佳。

出水VFA的組成也對反應器的運行狀況有重要影響，正常運行中，VFA濃度較低，出水VFA以乙酸為主，占VFA總量90%以上，只有少量丙酸與丁酸。當乙酸不能很好被甲烷菌利用時，底物會轉(zhuǎn)化為較多的丙酸與丁酸，丙酸與丁酸不能直接被甲烷菌利用，而產(chǎn)乙酸菌又不能很快適應這種狀況，從而有可能導致VFA的積累。

污泥中VFA的監(jiān)測也是重要的監(jiān)控手段，因為反應器中水流自下而上運動，因此反應器內(nèi)部VFA濃度的變化反映到出水要經(jīng)歷一段時間，尤其是反應器的啟動階段，進水量較小，水力停留時間較大，此時更應當頻繁檢測污泥中的VFA濃度以盡早發(fā)現(xiàn)和控制反應器狀態(tài)惡化的跡象。